Il laboratorio microbiologico esegue analisi  e test su vari tipi di matrice:

• Acque (uso umano, processo, piscina, termali, naturali e sotterranee)
• Alimenti
• Aria  (analisi indoor /ambienti di lavoro)
• Compost e digestati
• Mangimi 
• Materie prime e prodotti finiti
• Preparazioni farmacologiche (galeniche e non)
• Superfici di lavoro

Le analisi delle acque vengono effettuate per accertare l'idoneità ad uso umano, ad esempio per garantire l'assenza di batteri ad inquinamento fecale come Escherichia coli e Enterococchi intestinali e per verificare i requisiti di igiene delle vasche di balneazione come le piscine escludendo la presenza di batteri patogeni come Pseudomonas aeruginosa e stafilococchi.

Negli alimenti vengono ricercati batteri che possono essere responsabili di tossinfezioni alimentari come Salmonella spp, Listeria monocytogenes, Escherichia coli, e altri batteri normalmente presenti nell'ambiente che possono provocare malattie nell'uomo come Staphylococcus aureus, Bacillus cereus, Clostridium perfringens. 

Il laboratorio offre supporto al settore aziendale nella valutazione del rischio biologico ed in particolare del rischio Legionellosi, in conformità all’art. 271 comma 5 del D.Lgs. 81/2008 e alle Linee guida per la prevenzione e il controllo della legionellosi del 7 maggio 2015 (Linee guida per la legionellosi). Il servizio consiste nell' eseguire un sopralluogo iniziale ed In base alla valutazione dei rischi, vengono eseguite analisi di laboratorio su diverse matrici, quali acqua, aria, superfici e materie prime, come ad esempio i liquidi lubrorefrigeranti ed infine, sulla base dei risultati ottenuti, si procederà alla redazione del manuale e/o del protocollo per l'analisi e il monitoraggio della legionella, includendo punti di campionamento, azioni preventive, registro delle analisi, interventi di manutenzione e altre procedure correlate.
Le analisi principali che vengono eseguite per la valutazione del Rischio Biologico servono a valutare la presenza di potenziali agenti biologici coinvolti nelle attività lavorative. Oltre la Legionella  pneumophila, vengono eseguite analisi volte a monitoirare anche batteri che possono essere patogeni per l'uomo tra cui le enterobatteriacee che sono molte volte causa di infezioni gastrointestinali. Altre analisi che il laboratorio effettua sono quelle dell'aria in ambienti indoor in cui si possono trovare microrganismi come le muffe che possono causare allergie in soggetti ipersensibili. I dati poi raccolti vengono elaborati secondo l’European Collaborative Action mediante l’ applicazione dell’ Indice di contaminazione (IGCM-Dacarro) biologica quale misura complessiva dell’ inquinamento microbico ambientale.